在《宠物小精灵剧场版11》中，小智一行人意外踏入了一座被遗忘的古代秘境，这里居住着传说中的时间宝可梦“凯洛斯特”，它拥有逆转时间与改变景象的能力，却因千年前被封印的因果逐渐崩溃，导致自然规律紊乱、时空混乱，甚至威胁到了整个世界；为了拯救秘境和冒险中结识的神秘少女莉蕾与她的伙伴迷雾球，小智与皮卡丘携手众多宝可梦共同面对无法预测的时空风暴与一个觊觎凯洛斯特力量的阴谋集团，展开了一场跨越时间的终极对决！...