在未来的赛博朋克都市中，“黑暗蝴蝶”是一名神秘莫测的女忍者，她冷酷无情却又拥有一颗渴望救赎的心。作为代号“Kunoichi3”的秘密计划产物，她被从小训练为无情的杀戮机器，专门执行阴影中的刺杀任务。然而，在一次任务中意外发现秘密的真相后，她的世界彻底颠覆：自己竟是政府暗中进行生化改造实验的孤儿之一，同时也成为贪婪权力斗争的牺牲品。为了追寻真相，她选择背叛组织，利用天赋与忍术潜逃到城市最黑暗的地下世...